Ci dessus : Pottok en liberté au Pays basque

Mon récent séjour biarrot m’a permis d’enquêter sur la biodiversité de la ville basque et de ses environs. Voici donc un petit aperçu.

Biarritz est une ville du littoral et possèdent la richesse des écosystèmes d’interface entre continent et océan. Elle regroupe ainsi des variétés du golfe de Gascogne et de l’Europe entière. Bien que le territoire ne possède pas d’espèces endémiques à proprement parler, on peut parler d’espèces patrimoniales comme le pottok (ci-dessus) qui a un ancrage culturel fort. La musique basque a par exemple imité le galop du pottok à travers le txalaparta (prononcé tchalaparta). Avec des pilons en bois, le musicien frappe des planches (châtaignier, hêtre, merisier…) : le son produit s’apparente à celui des sabots martelant la terre.

Oiseau du lac Mouriscot

Biarritz à ce jour compte deux zones Natura 2000* : le lac Mouriscot protégé au titre de la Directive Habitat et les rochers de Bouccalot et de la Roche Ronde qui ont un zonage de protection au titre de la Directive Oiseaux.

Une pipistrelle de Kuhl juvénile

Le lac Mouriscot s’étend sur 100 ha et comprend le lac lui-même, ses zones humides, les zones boisées et les prairies, soit une toposéquence favorable avec de la nourriture abondante pour les espèces venues y élire domicile. On y retrouve des mammifères tels que le chevreuil, le blaireau, le renard, le vison d’Europe mais aussi toute une avifaune : héron cendré, pivert, aigrette, sarcelle, martin pêcheur.

Ainsi on y retrouve des marais indispensable à la nidification d’espèces parmi lesquelles des chauve-souris parfois très rares comme le vespertilion à oreilles échancrées, la pipistrelle commune, de kuhl et pygmée. Le lac abrite aussi des reptiles et batraciens très rares tel l’alyte accoucheur, la grenouille agile, la rainette méridionale, le lézard des murailles mais aussi la cistude d’Europe, une espèce de tortue menacée par la fameuse tortue de Floride que les gens abandonnent dans la nature.

Un alyte accoucheur

Le territoire abrite aussi 3 ZNIEFF (zone d’intérêt écologique floristique et faunistique) et 250 ha de littoral biarrot classés ZICO (zone d’importance pour la conservation des oiseaux). Une trame verte et bleue est aussi mise en place pour relier les « réservoirs de biodiversité » (même si je n’aime pas ce terme) avec des corridors écologiques. C’est un plan d’urbanisme qui permet de lutter contre la fragmentation des habitats naturels et en quelque sorte d’insérer une continuité de successions écosystémiques cohérentes dans l’espoir de favoriser le maintien de la biodiversité.

On peut aussi évoquer le lac Marion, qui bien que non classé, constitue un refuge en milieu urbain pour une cinquantaine d’espèces d’oiseaux sédentaires mais aussi des oies de bernache qui s’y reposent l’hiver avant de migrer.

Le globicéphale noir

La région compte beaucoup d’espèces marines dont un quart de la biodiversité des cétacés : le grand dauphin, le globicéphale noir, le cachalot et la proximité du gouf de Capbreton est propice à certaines espèces de baleines. Cependant, du fait du réchauffement climatique, on observe une perturbation des communautés avec par exemple moins d’orques et de pingouins, les dauphins communs augmentant. En général, il y a une remontée de l’aire de répartition des espèces d’eau froide au profit d’espèces adaptées à des eaux plus chaude comme les balistes, les poissons lune et les puffins.

* Natura 2000 a pour objectif de préserver la diversité biologique en Europe par la constitution d’un réseau des sites naturels les plus importants. La préservation des espèces protégées et la conservation des milieux visés passent essentiellement par le soutien des activités humaines et des pratiques qui ont permis de les sauvegarder jusqu’à ce jour.

Hymenolepis microstoma

La biodiversité, c’est quoi pour vous?

Des oiseaux de toutes sortes, des fleurs de toutes les couleurs, des animaux de la savane, un panda ?  L’évolution a conduit à une diversité du vivant surpassant notre imagination, autant dans l’infiniment grand que dans l’infiniment petit. Une bibliothèque du vivant dont les espèces sont autant de livres riches de connaissances qu’il reste à découvrir. Sceptique? Susan Perkins, parasitologue à l’American Museum of Natural History, nous propose une toute autre odyssée…

Birds of all kind, flowers of all colors, animals from the savannah, a panda? Evolution led to a biodiversity outstanding any expectations at every scale. A library of the living in which each specie is an unread book full of knowledge. Sceptical ? Susan Perkins, parasitologist at the American Museum of Natural History, opens the door to a unusual kind of odyssey…

Parasite of the day

A travers le site Daily Parasite, Susan Perkins offre un podium à 365 parasites triés sous la loupe : un par jour. Chaque parasite a droit à un petit portrait expliquant son mode de vie et ses particularités. C’est ainsi tout un univers insoupçonné et insoupçonnable que notre « hôte » se propose de nous faire découvrir. L’occasion était trop belle pour ne pas poser quelques questions à cette spécialiste à l’occasion de l’année de la biodiversité à laquelle cette initiative fait écho.

Daily Parasite is more than a website, it’s a showcase offering 365 parasites a place under the spotlight : one per day. Each parasite has its description to expose its features and way of transmission. Our « host » is inviting us to explore a whole universe we could never have imagined. Of course I had to ask this specialist some questions for the sake of the Year of the Biodiversity.

- Why should we preserve  biodiversity?

-  Pourquoi préserver la biodiversité?

There are several reasons.  For one, we never know what knowledge and products will come from discovering new and different species.  A good example is the discovery this week of a snail with incredibly tough armor that they are now saying may offer inspiration for body armor for people. Another reason is simply, diverse communities and habitats are healthy communities and habitats.  And parasites are part of that (see below).

Un escargot à la coquille dure

Il y a plusieurs raisons. La première est qu’on ne sait jamais quelles connaissances et quels fruits nous pouvons tirer de la découverte de nouvelles espèces. Un bon exemple est la découverte cette semaine d’un escargot avec une armure particulièrement résistante dont on dit qu’elle pourrait inspirer la conception d’armures adaptées à l’homme. Une autre raison est simple : des communautés et des habitats sains sont des communautés et des habitats diversifiés. Et les parasites participent à cela.

- How is biodiversity seen in the field of parasitology?

- Du point de vue de la parasitologie, comment voit on la biodiversité ?

Parasitologists know that they work on an incredibly diverse group of organisms.  If we assume that every organism on the planet has at least one specific parasite (almost certainly a gross understatement), then there are way more parasites than anything else (…) But a lot of other folks don’t really think about parasites – they’re small, they can be a little hard for the squeamish, and they are often seen as things you don’t want around.

Les parasitologues savent qu’ils travaillent sur un groupe d’organismes très diversifié. Si nous supposons que chaque organisme sur la planète abrite au moins un parasite (ce qui est peu dire), alors il y a plus de parasites que quoique ce soit d’autre (…) Mais beaucoup de gens ignorent les parasites – ils sont petits, pas très glamours et sont souvent vus comme des choses qu’on préfère garder à distance.

- Is the diversity of parasites threatened?

- Est ce que cette diversité des parasites est menacée ?

Sadly – very.  Their diversity is threatened because their hosts are threatened.  And their diversity is threatened because human impacts to the environment could alter their transmission and drive them extinct very quickly.

Malheureusement, oui. Ils sont menacés car leurs hôtes sont menacés. Ils sont menacés à cause de l’impact de l’anthropisation sur l’environnement qui peut altérer leur transmission et conduire à leur extinction rapide.

- What is the role of parasites in their ecosystems?

- Quel est le rôle des parasites dans leurs écosystèmes?

They are vital for healthy ecosystems.  It may seem counter-intuitive, but disease promotes diversity in ecosystems.  A good example can be seen in the post from January 15th, written by Tommy Leung.  The parasite in this case makes it difficult for the clam host to burrow and so they are more often predated by birds.  But the dead clams on the substrate make the habitat more varied – it gives other organisms a place to live. In addition to these ecological reasons, parasites are also important for promoting the genetic variation of their hosts.  Curt Lively has done some excellent work on this, for example.

Un parasite des arthropodes qui peut tuer les mâles, les féminiser mais aussi permettre aux femelles de se reproduire par parthogénèse

Ils sont essentiels à des écosystèmes sains. Cela peut sembler contre-intuitif, mais en fait les maladies promulguent la diversité dans les écosystèmes. Un bon exemple peut être vu dans l’article du 15 janvier, écrit par Tony Leung. Le parasite en question altère la capacité de la palourde hôte à s’ensevelir dans le sable ce qui la rend plus vulnérable à la prédation par les oiseaux. Or les coquilles de ces bivalves participent à fabriquer un habitat plus hétérogène qui permet d’abriter des individus d’autant plus variés. En plus de ces raisons écologiques, les parasites sont aussi important pour promouvoir la variabilité génétique de leurs hôtes. Curt Lively a fait un excellent travail là dessus.

- How useful is the field of parasitology ?

- Quelle est l’importance de la parasitologie ?

It’s incredibly useful, but has waned a lot in the past few decades.  We desperately need people who are trained to collect, identify and otherwise study parasites.  But work done on these organisms has formed some of our key understandings in ecology and evolution, genetics, immunology, etc.

Envie de voir par vous même? C'est ici =>

C’est incroyablement utile, mais cela a été délaissé énormément ces dernières dizaines d’années.  Nous manquons cruellement de gens qualifiés pour collecter, identifier sinon étudier les parasites alors que le travail fait en la matière constitue est une des clés essentielle à la compréhension de l’écologie et de l’évolution, de la génétique, de l’immunologie, etc.

Levons les yeux de la loupe

Le mot Ecologie vient du grec « oikos », qui veut dire maison et « logos » qui veux dire science, discours. Maison, l’humanité a une seule maison, la Terre.

Pourquoi cette maison est précieuse?

Parce qu’à l’intérieur, nous pouvons faire plein de choses, il y a plein d’activités. Ces activités économiques, écologiques, culturelles (comme le voyage) reposent sur biodiversité : la diversité du vivant et des écosystèmes. Gardons cette conscience qu’une fois une espèce disparaît de cette maison, elle est perdu une fois pour toute.

L’uniformité c’est la mort, la diversité c’est la vie. Bakounine

La nature rend des services écosystémiques : les écosystèmes naturels, les plantes et les animaux qu’ils renferment, fournissent à l’être humain des services qu’il serait très difficile de reproduire : la nourriture, la régulation du climat, la purification de l’eau mais aussi et ne l’oublions pas des services culturels.

Car avant de parler de biodiversité, il est important de réaliser l’importance de la diversité :

mon histoire est différente de la votre, quelqu’un d’autre que moi écrirait un autre article que celui ci ou de manière différente ; les histoires que l’on raconte à nos enfants le soir pour qu’ils s’endorment sont issus sur l’imagination, les croyances, les mythes et légendes de cultures diverses. Et ces cultures ne sont différentes que parce qu’elles sont nées d’environnements divers. C’est ça la richesse de notre planète.

Marché de Ljubljana

Imaginez qu’il n’y ai plus cette diversité, qu’en voyageant vous ne trouviez que ce que vous trouvez à deux pas de chez vous, le même fast food, le même magasin de vêtements, les mêmes paysages ; à quoi cela servirait il de voyager? Je me demande souvent comment c’était de voyager il y a 40 ans, sans internet, sans portable avec juste son sac sur le dos, obliger de s’ouvrir aux autres, discuter des nuits entières, changer ses habitudes, aller là où nulle caméra est allée ; dans des pays ayant chacun véritablement leur identité…

Chose qui disparaît petit à petit avec une tendance à l’uniformisation des cultures et des modes de pensée. Plus on plonge profondément dans l’Histoire au contraire, plus on trouve de civilisations différentes, avec leur culture, leurs architectures, leur perception du monde qui aujourd’hui se sont inscrits dans le patrimoine de l’humanité. De cette richesse, un foisonnement d’idées, d’inventions, de couleur, de musique, de traditions, de tenues vestimentaires, de cuisines! Justement, que serait le voyage, si l’on devait manger la même chose partout au quatre coins du monde?

Revenons à l’écologie :

Ecolo? non honnêtement je ne vois pas ce que cela veut dire. On parle d’écogestes, gestes verts, d’écocitoyens ; cela veut-il dire que le citoyen par définition n’est pas soucieux de l’environnement, qu’un geste est pollueur?

Il faudra beaucoup d’audace, DE REBELLION et de ténacité pour faire avancer les choses.

P. F. NAI

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« L’ingénierie écologique désigne la gestion de milieux et la conception d’aménagements durables, adaptatifs, multifonctionnels, inspirés de, ou basés sur, les mécanismes qui gouvernent les systèmes écologiques. Les processus purement chimiques ou physiques ne relèvent pas du périmètre de l’ingénierie écologique.

A ce titre, l’ingénierie écologique est un ensemble conceptuel spécifique des sciences écologiques mais ouvert sur les problèmes économiques et sociaux. Elle se distingue donc du développement soutenable, qui se base sur une logique économique respectueuse de l’environnement et du progrès social.  » – définition du CNRS

L’un des buts de l’ingénierie écologique est la réhabilitation des écosystèmes.

La réhabilitation d’un écosystème

L’homme dépend de la nature pour certains services appelés services écosystémiques (Millenium Assessment) :

1. Approvisionnement : eau, nourriture, bois, oxygène etc.
2. Régulation : régulation du climat, stockage du carbone par une forêt en croissance
3. Services culturels : éducation etc.
4. Maintien d’un lieu favorable à la vie : cycle des nutriments, formation des sols etc.

Un des buts de la réhabilitation d’un écosystème est de retrouver un ou plusieurs de ces services écologiques. Les organismes ingénieurs créent, modifient, détruisent ou maintiennent des habitats par leurs actions mécaniques (Jones et al, 1994) et ont,  par ce fait, un impact sur les conditions abiotiques et biotiques (biodiversité) d’un biotope. Ils peuvent être :

1. autogéniques comme les arbres qui par leur propre structure physique constituent de véritables habitats ayant un impact sur la lumière et le vent.
2. allogéniques à l’image des castors, l’archétype de l’organisme ingénieur, qui coupent du bois, construisent et conservent des barrages abritant des plantes sensibles à la lumière, des invertébrés vivants en eaux calmes. Ces derniers vont nourrir les poissons qu’on peut pêcher (services écologiques).

Ainsi, ils représentent potentiellement des partenaires de choix pour l’ingénierie écologique qui permettent, de par leur nature autonome, de réduire les efforts à produire par l’homme dans l’entreprise d’une restauration d’écosystème ou de la gestion d’espèces invasives. Le modèle proposé dans l’article illustre, entre autres, leur influence sur le passage d’un état à un autre d’un écosystème.

Comprendre l’influence des organismes ingénieurs et l’intérêt à les utiliser

De prime abord, les organismes ingénieurs agissent comme des enzymes sur une réaction chimique. Ils facilitent ou catalysent le passage d’un état de l’écosystème à l’autre en abaissant la barrière d’efforts à fournir par l’homme pour passer d’un état à un autre. En fait ce n’est pas tout à fait vrai, et même faux. Un écosystème est beaucoup plus compliqué qu’une réaction chimique et les organismes ingénieurs vont influer sur l’état final atteint. On peut alors se demander s’il s’agit vraiment d’une restauration proprement dite ou si d’une manière générale, on ne chercherait pas à amener un écosystème à un état intéressant pour l’homme plutôt que de le réhabiliter vraiment. C’est une question importante dès lors que l’on veut utiliser des organismes ingénieurs dans un objectif de « restauration ».

En effet, si on les introduits dans un écosystème, on ne se ramène plus exactement à l’état « initial ». De plus si on veut à terme, restaurer un écosystème et réintroduire avec succès des espèces qui avaient disparues, il est important de vérifier qu’elles peuvent potentiellement coexister avec le(s) organisme(s) ingénieur(s) dont on s’est servi. Enfin la définition des organismes ingénieurs, précise qu’ils peuvent très bien détruire un habitat. Se pose alors la question du choix des espèces ingénieurs.

Comment choisir ?

Peut-on toujours introduire ces organismes avec succès ? Quel risque y a-t-il à cette introduction? Autant de question à travailler en amont. En effet, un exemple d’utilisation d’organismes vivants dans l’intérêt de l’homme dans un contexte écologique est la lutte biologique contre des indésirables via des ennemis naturels. Or, il y a eu des ratés comme par exemple :

-          l’introduction des coccinelles aux Etats Unis contre les pucerons qui a accéléré l’extinction d’un Lycaenidé et supprimé des espèces de coccinelles indigènes par compétition ou prédation.

-          L’introduction de mangoustes dans les Antilles pour lutter contre les rats et les serpents qui a amené à l’extinction de populations d’oiseaux et de lézards.

Il convient donc de prendre des précautions élémentaire car contrairement à la lutte biologique, l’emploi d’organisme ingénieurs résultent en des conséquences complexes, de grandes ampleurs et difficile à gérer comme l’introduction d’espèces invasives associées. Il faut donc :

• Une bonne connaissance a priori de l’écosystème de la cible (biologie de la cible, structure du réseau trophique)
• Prévoir via les modèles, tester via l’expérimentation à diverses échelles
• un suivi à long terme
• un choix de l’organisme ingénieurs minutieux (screening complet des organismes potentiels, biologie des organismes (sensibilité aux conditions environnementales, capacité de dispersion : sujet de mon stage de M1 sur la dispersion des vers de terre)

Le ver de terre, mon exemple d’organisme ingénieur…

Je terminerai positivement sur cet exemple d’organisme ingénieur qu’on commence à utiliser.  Les vers de terre fabriquent un véritable environnement : la drilosphère et concentrent les ressources dans les agrégats biogéniques (les turricules) qu’ils produisent. Ils  créent des patchs de nutriments pour l’ensemble de la faune et la flore du sol, et augmentent souvent la croissance des plantes (Scheu 2003). Ainsi, ils peuvent jouer un rôle considérable dans l’agriculture (Senapati et al, 1999) car dans les agrosystèmes, l’intensification, recourt généralement à l’utilisation de pesticides, et au travail mécanique du sol, qui conduisent à la dégradation globale de ces écosystèmes et de la biodiversité, et au final, à une moindre fertilité du sol (Mäder, Fliebbach et al. 2002).

Les organismes ingénieurs sont des partenaires de choix, il faut cependant les utiliser avec précaution, on ne voudrait pas se retrouver avec des vers de terre et des castors partout…

Philippe F. NAI

Vue sur la ligne verte

Depuis 30 ans, Chypre est divisée en deux : au Sud, l’officielle et désormais européenne République de Chypre ; au Nord, la République turque de Chypre Nord, reconnue par la seule Turquie. En 1974, l’armée turque est intervenue dans le Nord de l’île pour protéger la minorité turque, à la suite d’un coup d’État nationaliste soutenu par le régime grec.

Au bord de l’extinction avant la création de la zone tampon, la population de mouflon à Chypre a aujourd’hui atteint 3000 individus grâce à un écosystème auxquel l’homme n’a plus accès. Cette zone démilitarisée est devenu par définition une réserve naturelle. Qu’est ce que ça veut dire?

Juste que la planète se passe très bien de nous.

Une fine bande de terre sépare la partie turque et la partie grecque

Il s’agit alors, non pas de « sauver la planète » mais de nous permettre à nous les êtres humains de vivre dans un monde qui nous soit agréable et où foisonne la diversité du vivant, la diversité des cultures, un environnement qui ne nous soit pas nocif physiquement et qui puissent l’épanouir intellectuellement.

3000 c’est un chiffre d’espoir mais on reste dans le rouge : le mouflon reste une espèce menacée. Petit à petit cette espèce emblématique ainsi que d’autres espèces ont pu retrouver un habitat non soumis au stress causé par l’homme.

La première cause de perte de biodiversité est la dégradation des habitats par l’homme.

En fait, quand on veut conserver, revaloriser un habitat, on recourt aux espèces emblématiques (ici le mouflon), qui sont caractéristiques de cet habitat. Les mesures visant à l’amélioration d’un habitat profitent aussi aux autres habitants de l’habitat. Ce sont aussi des espèces médiatiques, autour desquels il est souvent plus facile de communiquer, pensez au panda de WWF. Iris Charalambidou, spécialiste de l’avifaune nous a aussi donné un livret sur la biodiversité symbole du travail conjoint entre grecque et turcque. (ci dessous)

Quand je lui ai demandé si elle trouvait que ce projet était un symbole de réconciliation des peuples autour de la nature, elle me répondit de manière très simple « Non, pas particulièrement mais cela démontre que l’homme s’est toujours accordé autour de passions communes, ça peut être autour de la culture où ici de la biodiversité, c’est pour cela qu’il faut que nous, scientifiques, continuons à sensibiliser les gens pour qu’ils réalisent qu’à Chypre, ils ont ce patrimoine unique et commun ».

S’il y a bien une initiative dans l’émission qui illustre cette aspect « duplicable » c’est bien l’initiative de Chypre: « Cette idée nous vient de Bosnie, nous l’avons appliquée avec succès ici et elle est appliquable en Corée où il existe une zone tampon« . Souligne Nicolas Jarraud.

Retrouver le reportage ici

Restons ZEN et POSITIF!

Philippe F. NAI